云南省卫生科技教育协会党支部原名为云南省卫生科技教育管理协会党支部，于2019年10月经云南省卫生健康委机关党委批准成立，确定为功能型党支部。2023年6月20日云南省卫生科技教育管理协会召开第三次会员代表大会，完成协会换届，经向云南省民政厅社会组织管理局登记备案获得批准，协会更名为云南省卫生科技教育协会；2023年8月1日获得了省民政厅社会组织党委对协会党支部书记任职的批复。现有正式党员3名，支部书记由秘书长吕琳担任。
在上级党委的正确领导下，协会党支部以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面贯彻落实党的二十大精神，忠诚拥护“两个确立”，增强“四个意识”、坚定“四个自信”、做到“两个维护”，不断加强支部自身建设，践行社会主义核心价值观，党风廉政建设常抓不懈。积极探索新时期协会党建工作机制，坚持和完善“三会一课”制度、第一议题学习制度、主题党日活动等，发挥好基层组织的战斗堡垒作用和党员的先锋模范作用。坚持以党建为引领，党建工作与协会业务工作深度融合，相互促进，提升协会的服务品牌，助力协会高质量发展，促进我省卫生科技教育事业的健康发展。